توصيف جزئى لثلاث عزلات من فيروس واى البطاطس Potato virus Y

نوع المستند : Original Article

المؤلفون

قسم أمراض النبات كلية الزراعة الشاطبي جامعة الإسكندرية، الإسكندرية، مصر.

المستخلص

أثناء الفحص الميدانى لبعض حقول البطاطس فى محافظات البحيرة والدقهلية وكفر الشيخ بجمهورية مصر العربية وجد أن الأعراض الأكثر انتشاراً على النباتات المصابة طبيعياً هى: الموزايك المعتدل الى الشديد، الأصفرار، البرقشة، تحزم العروق، ارتفاعات موضعية لسطح الورقة و/أو التقزم. هذه الأعراض يتوقع ارتباطها بالإصابة بفيروس واى فى البطاطس (PVY) والتى تم اختبارها باستخدام تفاعل النسخ العكسى وتفاعل البوليميريز المتسلسل الكمى(RT-qPCR) حيث أعطت العينات المختبرة ناتج مضاعفة (PCR-product) طوله 480 زوج من القواعد وذلك باستخدام زوج من البادئات المتخصصة لجين الغطاء البروتينى. وقد أعطى الكشف بتفاعل الإليسا غير المباشرة باستخدام المصل المضاد المتخصص لفيروساتPVY, PVX, PVM, PVS  نتيجة ايجابية للإصابة بفيروسPVY . وبناءاً أيضاً على الأعراض وشدة المرض على نباتات دخان من نوع جلوتينوزا (Nicotiana glutinosa) تم اختيار ثلاث عزلات وتسميتهم "عزلة بدر" و"عزلة وادى" (من محافظة البحيرة) وعزلة طلخا (من محافظة الدقهلية) للاستخدام فى هذه الدراسة. حيث أعطت عدوى سبعة أنواع من العوائل المشخصة التابعة  للعائلة الباذنجانية والعائلة القطيفية بالثلاث عزلات مجموعة متباينة من الأعراض المميزة للإصابة بفيروس PVY وكانت الأعراض خفيفة إلى معتدلة ،على التوالى مع العزلتين "بدر" و"طلخا"، بينما كانت الأعراض شديدة فى حالة العزلة "وادى". تم تنقية ناتج RT-qPCR للعزلة "بدر" والعزلة "وادى" وتحديد تتابع جين الغطاء البروتينى لهما باستخدام برنامج Chromas Pro.  الإصدار 1.34. أيضا أجريت مقارنة التتابعات لهذه العزلات مع 25 عزلة فيروس PVY معزولة ومسجلة ببنك الجينات مسبقاً وتحليل درجة القرابة (Phylogenetic analysis) بينها، حيث اتضح أن نسبة القرابة للعزلة "بدر" تصل إلى 99.76% مع السلالة PVY NTN  (العزلة الايرلندية) بينما وصلت إلى 99.42% بين العزلة "وادى" والسلالة PVY-Wilga (العزلة الصينية).

الكلمات الرئيسية

الموضوعات الرئيسية

مجلة الإسکندرية للتبادل العلمى
المجلد 45، العدد 3
يوليو- سبتمبر
سبتمبر 2024
الصفحة 439-454

ملفات

شارك

إرسال الاستشهاد إلى

الإحصائيات